Απολιθώματα μειόκαινου

Η εποχή του μειόκαινου στην περιοχή του πάρκου εκπροσωπείται από ένα από τα πιο εντυπωσιακά και σημαντικά απολιθώματα, το δεινοθήριο (Deinotherium Giganteum), ένα είδος πρωτόγονου ελέφαντα. Σκελετικά τεμάχη του δεινοθήριου έχουν βρεθεί σε τρεις τοποθεσίες εντός των ορίων του πάρκου, που βρίσκονται κοντά στους οικισμούς Πετράς, Γέλας Αγίας Φωτιάς και Κατω Ζάκρος. Σήμερα, τα ευρήματα του δεινοθήριου από την ανασκαφή της Κατω Ζάκρου εκτίθενται στο Μουσείο Φυσικής Ιστορίας Κρήτης στο Ηράκλειο.

Επίσης, απολιθωμένα κελύφη και θραύσματα θαλάσσιων οργανισμών έχουν εντοπιστεί σε πάρα πολλές

  • Κοράλλια με χαρακτηριστικές εμφανίσεις εντός υφαλογενών ασβεστολίθων βορείως της παραλίας Καρούμπες, εντός του φαραγγιού της Κάτω Ζάκρου και βορειοδυτικά του φαραγγιού της Μονής Τοπλού
  • Αχινοί (Clypeaster) και δίθυρα (Chlamys) εντός μαργών και μαργαϊκών ασβεστολίθων με χαρακτηριστικές εμφανίσεις βορείως της παραλίας Καρούμπες
  • Διάφορα τρηματοφόρα.